Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Rnf40Q3U319 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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Rnf40Q3U319 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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Rnf40Q3U319 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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Rnf40Q3U319 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Rnf40Q3U319 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Rnf40Q3U319 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Rnf40Q3U319 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Rnf40Q3U319 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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