Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trappc13Q3TIR1 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms