Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr215-201ENSMUST00000061723 4112 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Cep295-208ENSMUST00000161132 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Macc1-204ENSMUST00000222058 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Cdc27-203ENSMUST00000106962 3160 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm4788-203ENSMUST00000111989 3187 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC154462.1-201ENSMUST00000228897 2260 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm25765-201ENSMUST00000104100 132 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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