Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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ptchd1Q14B62 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms