Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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Sh3bp2Q06649 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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Sh3bp2Q06649 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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Sh3bp2Q06649 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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Sh3bp2Q06649 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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Sh3bp2Q06649 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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