Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ActbP60710 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ActbP60710 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ActbP60710 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ActbP60710 4930533N22Rik-201ENSMUST00000206433 3509 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ActbP60710 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ActbP60710 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ActbP60710 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ActbP60710 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ActbP60710 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ActbP60710 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ActbP60710 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ActbP60710 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ActbP60710 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ActbP60710 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ActbP60710 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ActbP60710 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms