Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VdrP48281 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VdrP48281 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VdrP48281 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
VdrP48281 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VdrP48281 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
VdrP48281 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
VdrP48281 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
VdrP48281 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
VdrP48281 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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VdrP48281 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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VdrP48281 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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VdrP48281 Gm43424-201ENSMUST00000200484 253 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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