Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Mir5710-201ENSMUST00000176884 69 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm45020-201ENSMUST00000205356 381 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms