Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Dnmt3bO88509 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms