Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Cwf19l2-201ENSMUST00000027027 4446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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Nedd9O35177 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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Nedd9O35177 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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Nedd9O35177 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Nedd9O35177 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Nedd9O35177 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Nedd9O35177 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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Nedd9O35177 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Nedd9O35177 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Vmn1r216-203ENSMUST00000228389 10213 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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