Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms