Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm35835-202ENSMUST00000216984 3350 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm25581-201ENSMUST00000083410 164 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm25765-201ENSMUST00000104100 132 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms