Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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