Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms