Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm35835-202ENSMUST00000216984 3350 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Obscn-201ENSMUST00000020732 23483 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm24930-201ENSMUST00000158315 83 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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Zbed3Q9D0L1 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.9 ms