Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 AC187103.4-202ENSMUST00000225091 230 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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