Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Clec18aQ7TSQ1 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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Clec18aQ7TSQ1 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Clec18aQ7TSQ1 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Clec18aQ7TSQ1 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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Clec18aQ7TSQ1 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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Clec18aQ7TSQ1 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Clec18aQ7TSQ1 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Clec18aQ7TSQ1 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Clec18aQ7TSQ1 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
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Clec18aQ7TSQ1 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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