Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm8995-201ENSMUST00000184842 7280 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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