Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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Hoxa13Q62424 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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Hoxa13Q62424 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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Hoxa13Q62424 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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Hoxa13Q62424 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.8 ms