Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ttc9Q3V038 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ttc9Q3V038 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ttc9Q3V038 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ttc9Q3V038 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ttc9Q3V038 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ttc9Q3V038 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Ttc9Q3V038 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc9Q3V038 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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