Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Rnf40Q3U319 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Rnf40Q3U319 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Rnf40Q3U319 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Rnf40Q3U319 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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Rnf40Q3U319 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Rnf40Q3U319 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf40Q3U319 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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