Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm24544-201ENSMUST00000103862 110 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm15148-201ENSMUST00000117602 156 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Csmd3-209ENSMUST00000162830 13012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm23781-201ENSMUST00000157940 308 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm22889-201ENSMUST00000158639 58 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm43814-201ENSMUST00000197851 413 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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