Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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ptchd1Q14B62 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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ptchd1Q14B62 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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ptchd1Q14B62 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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ptchd1Q14B62 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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ptchd1Q14B62 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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ptchd1Q14B62 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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ptchd1Q14B62 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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ptchd1Q14B62 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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