Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm27392-201ENSMUST00000185041 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms