Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PtprmP28828 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PtprmP28828 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PtprmP28828 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PtprmP28828 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PtprmP28828 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PtprmP28828 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PtprmP28828 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PtprmP28828 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PtprmP28828 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PtprmP28828 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PtprmP28828 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm37626-201ENSMUST00000194332 4563 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm8995-201ENSMUST00000184842 7280 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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