Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Olfr1309-206ENSMUST00000217452 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a2P08122 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a2P08122 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms