Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm2056J3QQ02 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms