Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm3646-201ENSMUST00000171319 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms