Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms