Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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Limd1Q9QXD8 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Limd1Q9QXD8 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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Limd1Q9QXD8 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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Limd1Q9QXD8 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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Limd1Q9QXD8 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Limd1Q9QXD8 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Limd1Q9QXD8 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Limd1Q9QXD8 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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