Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 4932431L22Rik-201ENSMUST00000193456 3140 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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Cln8Q9QUK3 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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Cln8Q9QUK3 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Arhgap12-205ENSMUST00000182066 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cln8Q9QUK3 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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