Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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