Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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Alyref2Q9JJW6 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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Alyref2Q9JJW6 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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Alyref2Q9JJW6 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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Alyref2Q9JJW6 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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Alyref2Q9JJW6 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Alyref2Q9JJW6 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Alyref2Q9JJW6 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Alyref2Q9JJW6 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Alyref2Q9JJW6 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Alyref2Q9JJW6 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Alyref2Q9JJW6 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Alyref2Q9JJW6 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Alyref2Q9JJW6 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Alyref2Q9JJW6 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Alyref2Q9JJW6 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Alyref2Q9JJW6 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Alyref2Q9JJW6 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Alyref2Q9JJW6 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Alyref2Q9JJW6 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Alyref2Q9JJW6 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Alyref2Q9JJW6 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Alyref2Q9JJW6 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Alyref2Q9JJW6 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Alyref2Q9JJW6 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Alyref2Q9JJW6 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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