Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Vmn1r71-208ENSMUST00000228374 3717 ntAPPRIS P2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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