Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Cep295-208ENSMUST00000161132 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 AC121997.2-203ENSMUST00000228613 4192 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm43236-201ENSMUST00000197414 313 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm43424-201ENSMUST00000200484 253 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm6639-202ENSMUST00000196841 2666 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms