Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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Ccdc88cQ6VGS5 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43236-201ENSMUST00000197414 313 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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Ccdc88cQ6VGS5 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38107-201ENSMUST00000194873 696 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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