Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 AC138401.2-201ENSMUST00000220461 365 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NipblQ6KCD5 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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