Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms