Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Shroom4Q1W617 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Shroom4Q1W617 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Shroom4Q1W617 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Shroom4Q1W617 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm22908-201ENSMUST00000177620 110 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm23671-201ENSMUST00000157472 103 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Shroom4Q1W617 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms