Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm45031-201ENSMUST00000206800 288 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Vmn2r19-201ENSMUST00000073948 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm43424-201ENSMUST00000200484 253 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AC133598.4-202ENSMUST00000225267 469 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm13478-201ENSMUST00000118312 413 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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