Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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ptchd1Q14B62 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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ptchd1Q14B62 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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ptchd1Q14B62 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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ptchd1Q14B62 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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ptchd1Q14B62 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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ptchd1Q14B62 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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ptchd1Q14B62 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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ptchd1Q14B62 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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ptchd1Q14B62 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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ptchd1Q14B62 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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ptchd1Q14B62 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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ptchd1Q14B62 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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