Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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