Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm26145-201ENSMUST00000104476 127 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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