Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Nedd9O35177 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Vmn1r174-202ENSMUST00000228331 9058 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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Nedd9O35177 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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Nedd9O35177 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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Nedd9O35177 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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Nedd9O35177 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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Nedd9O35177 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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Nedd9O35177 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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Nedd9O35177 Olfr393-202ENSMUST00000213365 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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Nedd9O35177 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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Nedd9O35177 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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Nedd9O35177 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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Nedd9O35177 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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