Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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