Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Olfr393-202ENSMUST00000213365 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp29Q9ES63 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms