Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm26145-201ENSMUST00000104476 127 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm45020-201ENSMUST00000205356 381 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Tbx22-201ENSMUST00000068451 2947 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 1700027F06Rik-201ENSMUST00000203901 243 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccdc47Q9D024 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms