Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rprd1bQ9CSU0 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms