Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Cep295-208ENSMUST00000161132 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm13268-201ENSMUST00000117485 433 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr815-202ENSMUST00000216182 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms