Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cnot1Q6ZQ08 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm45006-201ENSMUST00000206078 690 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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